实时荧光定量PCR可以在反映处于指数期时，检测PCR产物的量，由此推断初始模板。实时荧光定量PCR使用的荧光化学主要分为两种类型：荧光探针法和荧光染料法。

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Infinium全基因组SNP分型

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棉花全基因组表达谱芯片所用的序列信息来自于RefSeq, UniGene, TIGR Plant TA 和TIGR Gene Indices等知名数据库，代表了43,803个棉花基因和转录本。

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采用Infinium技术，无需PCR反应，不依赖限制性内切酶，芯片反应通过等位基因特异性延伸来完成，保证了高质量的实验数据。

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